Protein–RNA interactions for Protein: Q15293

RCN1, Reticulocalbin-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN1Q15293 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RCN1Q15293 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
RCN1Q15293 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RCN1Q15293 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RCN1Q15293 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms