Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SPIDRQ14159 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPIDRQ14159 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIDRQ14159 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPIDRQ14159 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPIDRQ14159 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIDRQ14159 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPIDRQ14159 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPIDRQ14159 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPIDRQ14159 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPIDRQ14159 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPIDRQ14159 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SPIDRQ14159 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
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