Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
COL4A6Q14031 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
COL4A6Q14031 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
COL4A6Q14031 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
COL4A6Q14031 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
COL4A6Q14031 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
COL4A6Q14031 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL4A6Q14031 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
COL4A6Q14031 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL4A6Q14031 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL4A6Q14031 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL4A6Q14031 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL4A6Q14031 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL4A6Q14031 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
COL4A6Q14031 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL4A6Q14031 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL4A6Q14031 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL4A6Q14031 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
COL4A6Q14031 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL4A6Q14031 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
COL4A6Q14031 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL4A6Q14031 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL4A6Q14031 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL4A6Q14031 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL4A6Q14031 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
COL4A6Q14031 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL4A6Q14031 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL4A6Q14031 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
COL4A6Q14031 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL4A6Q14031 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL4A6Q14031 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
COL4A6Q14031 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
COL4A6Q14031 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL4A6Q14031 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL4A6Q14031 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL4A6Q14031 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL4A6Q14031 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL4A6Q14031 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
COL4A6Q14031 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL4A6Q14031 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL4A6Q14031 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
COL4A6Q14031 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
COL4A6Q14031 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
COL4A6Q14031 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
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