Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKAP5Q14008 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CKAP5Q14008 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CKAP5Q14008 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CKAP5Q14008 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CKAP5Q14008 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CKAP5Q14008 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CKAP5Q14008 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CKAP5Q14008 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKAP5Q14008 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKAP5Q14008 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKAP5Q14008 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKAP5Q14008 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CKAP5Q14008 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.64
CKAP5Q14008 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CKAP5Q14008 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CKAP5Q14008 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CKAP5Q14008 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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