Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDE7AQ13946 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE7AQ13946 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDE7AQ13946 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDE7AQ13946 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PDE7AQ13946 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
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