Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
EXOSC2Q13868 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EXOSC2Q13868 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
EXOSC2Q13868 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
EXOSC2Q13868 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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