Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOFQ13790 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOFQ13790 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOFQ13790 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOFQ13790 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOFQ13790 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
APOFQ13790 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOFQ13790 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOFQ13790 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOFQ13790 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOFQ13790 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOFQ13790 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
APOFQ13790 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOFQ13790 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
APOFQ13790 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOFQ13790 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOFQ13790 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOFQ13790 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
APOFQ13790 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOFQ13790 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOFQ13790 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
APOFQ13790 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
APOFQ13790 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOFQ13790 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOFQ13790 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOFQ13790 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
APOFQ13790 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOFQ13790 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOFQ13790 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOFQ13790 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOFQ13790 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
APOFQ13790 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOFQ13790 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOFQ13790 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOFQ13790 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOFQ13790 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOFQ13790 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOFQ13790 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOFQ13790 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOFQ13790 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOFQ13790 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOFQ13790 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOFQ13790 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
APOFQ13790 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOFQ13790 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOFQ13790 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
APOFQ13790 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOFQ13790 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOFQ13790 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOFQ13790 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOFQ13790 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOFQ13790 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOFQ13790 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
APOFQ13790 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOFQ13790 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APOFQ13790 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOFQ13790 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOFQ13790 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOFQ13790 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
APOFQ13790 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOFQ13790 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
APOFQ13790 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOFQ13790 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOFQ13790 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOFQ13790 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOFQ13790 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
APOFQ13790 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOFQ13790 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOFQ13790 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOFQ13790 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOFQ13790 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOFQ13790 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOFQ13790 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
APOFQ13790 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOFQ13790 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOFQ13790 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
APOFQ13790 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
APOFQ13790 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23■■□□□ 1.27
APOFQ13790 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOFQ13790 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
APOFQ13790 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOFQ13790 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOFQ13790 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOFQ13790 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
APOFQ13790 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOFQ13790 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOFQ13790 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOFQ13790 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOFQ13790 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOFQ13790 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOFQ13790 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
APOFQ13790 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOFQ13790 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOFQ13790 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOFQ13790 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
APOFQ13790 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
APOFQ13790 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOFQ13790 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOFQ13790 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
APOFQ13790 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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