Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
PKD2Q13563 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
PKD2Q13563 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
PKD2Q13563 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
PKD2Q13563 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
PKD2Q13563 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
PKD2Q13563 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.26■■■■□ 3.56
PKD2Q13563 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
PKD2Q13563 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
PKD2Q13563 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
PKD2Q13563 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
PKD2Q13563 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PKD2Q13563 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
PKD2Q13563 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
PKD2Q13563 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
PKD2Q13563 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
PKD2Q13563 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
PKD2Q13563 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
PKD2Q13563 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.54
PKD2Q13563 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
PKD2Q13563 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
PKD2Q13563 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PKD2Q13563 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PKD2Q13563 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PKD2Q13563 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PKD2Q13563 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
PKD2Q13563 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
PKD2Q13563 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PKD2Q13563 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PKD2Q13563 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
PKD2Q13563 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PKD2Q13563 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
PKD2Q13563 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
PKD2Q13563 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PKD2Q13563 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PKD2Q13563 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
PKD2Q13563 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
PKD2Q13563 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PKD2Q13563 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
PKD2Q13563 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PKD2Q13563 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
PKD2Q13563 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
PKD2Q13563 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
PKD2Q13563 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PKD2Q13563 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PKD2Q13563 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
PKD2Q13563 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PKD2Q13563 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PKD2Q13563 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PKD2Q13563 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
PKD2Q13563 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
PKD2Q13563 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
PKD2Q13563 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PKD2Q13563 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PKD2Q13563 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
PKD2Q13563 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PKD2Q13563 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
PKD2Q13563 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
PKD2Q13563 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PKD2Q13563 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PKD2Q13563 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PKD2Q13563 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
PKD2Q13563 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
PKD2Q13563 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PKD2Q13563 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
PKD2Q13563 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
PKD2Q13563 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
PKD2Q13563 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
PKD2Q13563 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
PKD2Q13563 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
PKD2Q13563 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PKD2Q13563 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PKD2Q13563 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
PKD2Q13563 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PKD2Q13563 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PKD2Q13563 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
PKD2Q13563 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
PKD2Q13563 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
PKD2Q13563 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PKD2Q13563 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
PKD2Q13563 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
PKD2Q13563 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
PKD2Q13563 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
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