Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SQSTM1Q13501 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SQSTM1Q13501 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SQSTM1Q13501 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SQSTM1Q13501 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
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