Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXE3Q13461 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
FOXE3Q13461 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
FOXE3Q13461 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXE3Q13461 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXE3Q13461 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
FOXE3Q13461 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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