Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LSAMPQ13449 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSAMPQ13449 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSAMPQ13449 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LSAMPQ13449 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LSAMPQ13449 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSAMPQ13449 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSAMPQ13449 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSAMPQ13449 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSAMPQ13449 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LSAMPQ13449 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSAMPQ13449 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LSAMPQ13449 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSAMPQ13449 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSAMPQ13449 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSAMPQ13449 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSAMPQ13449 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSAMPQ13449 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LSAMPQ13449 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LSAMPQ13449 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LSAMPQ13449 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSAMPQ13449 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSAMPQ13449 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSAMPQ13449 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSAMPQ13449 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSAMPQ13449 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSAMPQ13449 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LSAMPQ13449 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LSAMPQ13449 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LSAMPQ13449 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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