Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CSTF3Q12996 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSTF3Q12996 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSTF3Q12996 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSTF3Q12996 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSTF3Q12996 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSTF3Q12996 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSTF3Q12996 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSTF3Q12996 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSTF3Q12996 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSTF3Q12996 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSTF3Q12996 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSTF3Q12996 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSTF3Q12996 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSTF3Q12996 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSTF3Q12996 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSTF3Q12996 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSTF3Q12996 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSTF3Q12996 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSTF3Q12996 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSTF3Q12996 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSTF3Q12996 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSTF3Q12996 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSTF3Q12996 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSTF3Q12996 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CSTF3Q12996 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CSTF3Q12996 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CSTF3Q12996 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms