Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BNIP1Q12981 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BNIP1Q12981 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BNIP1Q12981 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
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