Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FOXF1Q12946 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FOXF1Q12946 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FOXF1Q12946 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
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