Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMAN2Q12907 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMAN2Q12907 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMAN2Q12907 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMAN2Q12907 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMAN2Q12907 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMAN2Q12907 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMAN2Q12907 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMAN2Q12907 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LMAN2Q12907 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LMAN2Q12907 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LMAN2Q12907 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LMAN2Q12907 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LMAN2Q12907 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMAN2Q12907 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMAN2Q12907 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LMAN2Q12907 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMAN2Q12907 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LMAN2Q12907 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMAN2Q12907 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMAN2Q12907 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LMAN2Q12907 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMAN2Q12907 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LMAN2Q12907 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LMAN2Q12907 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
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