Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STX4Q12846 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STX4Q12846 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STX4Q12846 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STX4Q12846 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX4Q12846 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX4Q12846 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX4Q12846 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX4Q12846 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX4Q12846 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX4Q12846 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX4Q12846 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX4Q12846 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
STX4Q12846 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STX4Q12846 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX4Q12846 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STX4Q12846 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX4Q12846 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX4Q12846 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX4Q12846 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX4Q12846 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX4Q12846 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STX4Q12846 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX4Q12846 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX4Q12846 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX4Q12846 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX4Q12846 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX4Q12846 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX4Q12846 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX4Q12846 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX4Q12846 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX4Q12846 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STX4Q12846 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STX4Q12846 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STX4Q12846 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STX4Q12846 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX4Q12846 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX4Q12846 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX4Q12846 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX4Q12846 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX4Q12846 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX4Q12846 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX4Q12846 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STX4Q12846 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STX4Q12846 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
STX4Q12846 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX4Q12846 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX4Q12846 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX4Q12846 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
STX4Q12846 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX4Q12846 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX4Q12846 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX4Q12846 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX4Q12846 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
STX4Q12846 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX4Q12846 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX4Q12846 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX4Q12846 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX4Q12846 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX4Q12846 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX4Q12846 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
STX4Q12846 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
STX4Q12846 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STX4Q12846 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STX4Q12846 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STX4Q12846 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STX4Q12846 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
STX4Q12846 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
STX4Q12846 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
STX4Q12846 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
STX4Q12846 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX4Q12846 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
STX4Q12846 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX4Q12846 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX4Q12846 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
STX4Q12846 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX4Q12846 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX4Q12846 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX4Q12846 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX4Q12846 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX4Q12846 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX4Q12846 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
STX4Q12846 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX4Q12846 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX4Q12846 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX4Q12846 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX4Q12846 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX4Q12846 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
STX4Q12846 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX4Q12846 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX4Q12846 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX4Q12846 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
STX4Q12846 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX4Q12846 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX4Q12846 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
STX4Q12846 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX4Q12846 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX4Q12846 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
STX4Q12846 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
STX4Q12846 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms