Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 GDH1YOR375C 1365 nt8.24□□□□□ -1.09
LSP1Q12230 YJL213WYJL213W 996 nt8.24□□□□□ -1.09
LSP1Q12230 CRN1YLR429W 1956 nt8.24□□□□□ -1.09
LSP1Q12230 HPT1YDR399W 666 nt8.23□□□□□ -1.09
LSP1Q12230 DMC1YER179W 1005 nt8.23□□□□□ -1.09
LSP1Q12230 NMA2YGR010W 1188 nt8.23□□□□□ -1.09
LSP1Q12230 RRN10YBL025W 438 nt8.23□□□□□ -1.09
LSP1Q12230 SSC1YJR045C 1965 nt8.22□□□□□ -1.09
LSP1Q12230 YGL081WYGL081W 963 nt8.22□□□□□ -1.09
LSP1Q12230 PIL1YGR086C 1020 nt8.22□□□□□ -1.09
LSP1Q12230 ADE1YAR015W 921 nt8.22□□□□□ -1.09
LSP1Q12230 MHP1YJL042W 4197 nt8.22□□□□□ -1.09
LSP1Q12230 GSH1YJL101C 2037 nt8.21□□□□□ -1.1
LSP1Q12230 MEU1YLR017W 1014 nt8.21□□□□□ -1.1
LSP1Q12230 TAH11YJR046W 1815 nt8.21□□□□□ -1.1
LSP1Q12230 CMK2YOL016C 1344 nt8.21□□□□□ -1.1
LSP1Q12230 CDC13YDL220C 2775 nt8.2□□□□□ -1.1
LSP1Q12230 YCR049CYCR049C 447 nt8.2□□□□□ -1.1
LSP1Q12230 YOL099CYOL099C 492 nt8.2□□□□□ -1.1
LSP1Q12230 SMK1YPR054W 1167 nt8.2□□□□□ -1.1
LSP1Q12230 HBN1YCL026C-B 582 nt8.2□□□□□ -1.1
LSP1Q12230 YLL066CYLL066C 3618 nt8.2□□□□□ -1.1
LSP1Q12230 DPM1YPR183W 804 nt8.19□□□□□ -1.1
LSP1Q12230 CCT3YJL014W 1605 nt8.18□□□□□ -1.1
LSP1Q12230 RDN5-2RDN5-2 119 nt8.18□□□□□ -1.1
LSP1Q12230 RDN5-3RDN5-3 119 nt8.18□□□□□ -1.1
LSP1Q12230 RDN5-4RDN5-4 119 nt8.18□□□□□ -1.1
LSP1Q12230 RDN5-5RDN5-5 119 nt8.18□□□□□ -1.1
LSP1Q12230 TUF1YOR187W 1314 nt8.18□□□□□ -1.1
LSP1Q12230 CIT2YCR005C 1383 nt8.18□□□□□ -1.1
LSP1Q12230 TOS1YBR162C 1368 nt8.18□□□□□ -1.1
LSP1Q12230 MSG5YNL053W 1470 nt8.18□□□□□ -1.1
LSP1Q12230 GRH1YDR517W 1119 nt8.17□□□□□ -1.1
LSP1Q12230 PAM17YKR065C 594 nt8.17□□□□□ -1.1
LSP1Q12230 MSI1YBR195C 1269 nt8.17□□□□□ -1.1
LSP1Q12230 YAL045CYAL045C 309 nt8.16□□□□□ -1.1
LSP1Q12230 OPI11YPR044C 354 nt8.16□□□□□ -1.1
LSP1Q12230 YDR476CYDR476C 675 nt8.15□□□□□ -1.1
LSP1Q12230 EDC3YEL015W 1656 nt8.14□□□□□ -1.11
LSP1Q12230 MRP1YDR347W 966 nt8.14□□□□□ -1.11
LSP1Q12230 COX16YJL003W 357 nt8.14□□□□□ -1.11
LSP1Q12230 ICL2YPR006C 1728 nt8.14□□□□□ -1.11
LSP1Q12230 GPH1YPR160W 2709 nt8.14□□□□□ -1.11
LSP1Q12230 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.12□□□□□ -1.11
LSP1Q12230 YML122CYML122C 381 nt8.12□□□□□ -1.11
LSP1Q12230 YNR014WYNR014W 639 nt8.12□□□□□ -1.11
LSP1Q12230 RGD2YFL047W 2145 nt8.11□□□□□ -1.11
LSP1Q12230 HOG1YLR113W 1308 nt8.1□□□□□ -1.11
LSP1Q12230 DOC1YGL240W 753 nt8.1□□□□□ -1.11
LSP1Q12230 PAC2YER007W 1557 nt8.1□□□□□ -1.11
LSP1Q12230 RPL5YPL131W 894 nt8.09□□□□□ -1.11
LSP1Q12230 YPL247CYPL247C 1572 nt8.09□□□□□ -1.11
LSP1Q12230 ECM38YLR299W 1983 nt8.08□□□□□ -1.12
LSP1Q12230 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt8.08□□□□□ -1.12
LSP1Q12230 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt8.08□□□□□ -1.12
LSP1Q12230 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt8.08□□□□□ -1.12
LSP1Q12230 SUP51tL(UAA)J 84 nt8.08□□□□□ -1.12
LSP1Q12230 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt8.08□□□□□ -1.12
LSP1Q12230 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt8.08□□□□□ -1.12
LSP1Q12230 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt8.08□□□□□ -1.12
LSP1Q12230 DYS1YHR068W 1164 nt8.08□□□□□ -1.12
LSP1Q12230 YCR061WYCR061W 1896 nt8.07□□□□□ -1.12
LSP1Q12230 URH1YDR400W 1023 nt8.07□□□□□ -1.12
LSP1Q12230 HSP12YFL014W 330 nt8.07□□□□□ -1.12
LSP1Q12230 YJL045WYJL045W 1905 nt8.07□□□□□ -1.12
LSP1Q12230 HEL1YKR017C 1656 nt8.06□□□□□ -1.12
LSP1Q12230 CTF8YHR191C 402 nt8.06□□□□□ -1.12
LSP1Q12230 RTC4YNL254C 1206 nt8.06□□□□□ -1.12
LSP1Q12230 OPI8YKR035C 642 nt8.05□□□□□ -1.12
LSP1Q12230 NME1NME1 340 nt8.05□□□□□ -1.12
LSP1Q12230 MPE1YKL059C 1326 nt8.04□□□□□ -1.12
LSP1Q12230 YIA6YIL006W 1122 nt8.04□□□□□ -1.12
LSP1Q12230 PEX31YGR004W 1389 nt8.04□□□□□ -1.12
LSP1Q12230 NFS1YCL017C 1494 nt8.04□□□□□ -1.12
LSP1Q12230 PPH22YDL188C 1134 nt8.03□□□□□ -1.12
LSP1Q12230 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt8.03□□□□□ -1.12
LSP1Q12230 ADH5YBR145W 1056 nt8.03□□□□□ -1.12
LSP1Q12230 CBR1YIL043C 855 nt8.02□□□□□ -1.13
LSP1Q12230 TUB1YML085C 1344 nt8.02□□□□□ -1.13
LSP1Q12230 BDF2YDL070W 1917 nt8.01□□□□□ -1.13
LSP1Q12230 YLR358CYLR358C 564 nt8.01□□□□□ -1.13
LSP1Q12230 RPL31BYLR406C 342 nt8□□□□□ -1.13
LSP1Q12230 PLB2YMR006C 2121 nt8□□□□□ -1.13
LSP1Q12230 YPQ2YDR352W 954 nt7.99□□□□□ -1.13
LSP1Q12230 SOD2YHR008C 702 nt7.99□□□□□ -1.13
LSP1Q12230 YJR107WYJR107W 987 nt7.99□□□□□ -1.13
LSP1Q12230 SUR7YML052W 909 nt7.99□□□□□ -1.13
LSP1Q12230 YPR130CYPR130C 408 nt7.99□□□□□ -1.13
LSP1Q12230 PET494YNR045W 1470 nt7.99□□□□□ -1.13
LSP1Q12230 BRN1YBL097W 2265 nt7.99□□□□□ -1.13
LSP1Q12230 SMC5YOL034W 3282 nt7.98□□□□□ -1.13
LSP1Q12230 ECM27YJR106W 2178 nt7.98□□□□□ -1.13
LSP1Q12230 TRS31YDR472W 852 nt7.98□□□□□ -1.13
LSP1Q12230 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.98□□□□□ -1.13
LSP1Q12230 FUS3YBL016W 1062 nt7.98□□□□□ -1.13
LSP1Q12230 FCY22YER060W-A 1593 nt7.97□□□□□ -1.13
LSP1Q12230 AGP2YBR132C 1791 nt7.97□□□□□ -1.13
LSP1Q12230 REC107YJR021C 945 nt7.97□□□□□ -1.13
LSP1Q12230 ATP23YNR020C 813 nt7.97□□□□□ -1.13
LSP1Q12230 SLA2YNL243W 2907 nt7.97□□□□□ -1.13
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