Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CPSF1Q10570 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CPSF1Q10570 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CPSF1Q10570 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
CPSF1Q10570 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CPSF1Q10570 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CPSF1Q10570 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CPSF1Q10570 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CPSF1Q10570 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CPSF1Q10570 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CPSF1Q10570 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CPSF1Q10570 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CPSF1Q10570 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CPSF1Q10570 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CPSF1Q10570 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CPSF1Q10570 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CPSF1Q10570 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CPSF1Q10570 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CPSF1Q10570 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CPSF1Q10570 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CPSF1Q10570 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CPSF1Q10570 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CPSF1Q10570 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CPSF1Q10570 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CPSF1Q10570 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CPSF1Q10570 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CPSF1Q10570 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CPSF1Q10570 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CPSF1Q10570 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CPSF1Q10570 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CPSF1Q10570 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CPSF1Q10570 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CPSF1Q10570 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CPSF1Q10570 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CPSF1Q10570 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CPSF1Q10570 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CPSF1Q10570 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CPSF1Q10570 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
CPSF1Q10570 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CPSF1Q10570 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CPSF1Q10570 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CPSF1Q10570 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CPSF1Q10570 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CPSF1Q10570 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CPSF1Q10570 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
CPSF1Q10570 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CPSF1Q10570 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CPSF1Q10570 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CPSF1Q10570 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CPSF1Q10570 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CPSF1Q10570 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CPSF1Q10570 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CPSF1Q10570 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CPSF1Q10570 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CPSF1Q10570 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CPSF1Q10570 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CPSF1Q10570 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CPSF1Q10570 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CPSF1Q10570 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CPSF1Q10570 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CPSF1Q10570 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CPSF1Q10570 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
CPSF1Q10570 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CPSF1Q10570 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CPSF1Q10570 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CPSF1Q10570 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CPSF1Q10570 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CPSF1Q10570 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CPSF1Q10570 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CPSF1Q10570 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CPSF1Q10570 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CPSF1Q10570 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CPSF1Q10570 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CPSF1Q10570 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CPSF1Q10570 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CPSF1Q10570 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
CPSF1Q10570 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CPSF1Q10570 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CPSF1Q10570 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CPSF1Q10570 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CPSF1Q10570 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CPSF1Q10570 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CPSF1Q10570 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CPSF1Q10570 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CPSF1Q10570 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CPSF1Q10570 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CPSF1Q10570 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CPSF1Q10570 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CPSF1Q10570 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CPSF1Q10570 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CPSF1Q10570 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CPSF1Q10570 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CPSF1Q10570 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CPSF1Q10570 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CPSF1Q10570 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CPSF1Q10570 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
CPSF1Q10570 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CPSF1Q10570 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CPSF1Q10570 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CPSF1Q10570 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
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