Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC15Q0P6D6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC15Q0P6D6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC15Q0P6D6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC15Q0P6D6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC15Q0P6D6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC15Q0P6D6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC15Q0P6D6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC15Q0P6D6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC15Q0P6D6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC15Q0P6D6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC15Q0P6D6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC15Q0P6D6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC15Q0P6D6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC15Q0P6D6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC15Q0P6D6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC15Q0P6D6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC15Q0P6D6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC15Q0P6D6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC15Q0P6D6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC15Q0P6D6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC15Q0P6D6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC15Q0P6D6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC15Q0P6D6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC15Q0P6D6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC15Q0P6D6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC15Q0P6D6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCDC15Q0P6D6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC15Q0P6D6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC15Q0P6D6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.5 ms