Protein–RNA interactions for Protein: Q07020

RPL18, 60S ribosomal protein L18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL18Q07020 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RPL18Q07020 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RPL18Q07020 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL18Q07020 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL18Q07020 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL18Q07020 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL18Q07020 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL18Q07020 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL18Q07020 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL18Q07020 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL18Q07020 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL18Q07020 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL18Q07020 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL18Q07020 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL18Q07020 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL18Q07020 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL18Q07020 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL18Q07020 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL18Q07020 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL18Q07020 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL18Q07020 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL18Q07020 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL18Q07020 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms