Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 SUPT16H-203ENST00000555752 888 ntTSL 225.46■■□□□ 1.673e-8■■■■■ 41
FMR1Q06787 SUPT16H-205ENST00000556217 1027 ntTSL 220.23■□□□□ 0.833e-8■■■■■ 41
FMR1Q06787 SUPT16H-208ENST00000557652 877 ntTSL 516.74■□□□□ 0.273e-8■■■■■ 41
FMR1Q06787 SUPT16H-206ENST00000556309 582 ntTSL 36.45□□□□□ -1.383e-8■■■■■ 41
FMR1Q06787 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.411e-8■■■■■ 41
FMR1Q06787 MITF-209ENST00000448226 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.631e-8■■■■■ 41
FMR1Q06787 MITF-208ENST00000433517 589 ntTSL 310.51□□□□□ -0.731e-8■■■■■ 41
FMR1Q06787 MITF-214ENST00000472437 1995 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.731e-8■■■■■ 41
FMR1Q06787 MITF-207ENST00000429090 542 ntTSL 510.08□□□□□ -0.81e-8■■■■■ 41
FMR1Q06787 MITF-203ENST00000328528 4680 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.031e-8■■■■■ 41
FMR1Q06787 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.015e-7■■■■■ 40.9
FMR1Q06787 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.488e-10■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-221ENST00000479735 543 ntTSL 424.84■■□□□ 1.573e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-230ENST00000629955 1435 ntTSL 516.28■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-202ENST00000392861 1514 ntTSL 1 (best)16.08■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-231ENST00000630572 468 ntTSL 515.78■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-237ENST00000636732 5073 ntTSL 514.39□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-207ENST00000431672 709 ntTSL 412.64□□□□□ -0.393e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-209ENST00000435831 554 ntTSL 411.91□□□□□ -0.53e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-220ENST00000476394 601 ntTSL 311.71□□□□□ -0.533e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-212ENST00000453352 581 ntTSL 311.56□□□□□ -0.563e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-246ENST00000638128 8932 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.583e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-224ENST00000539609 4061 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.593e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-222ENST00000484313 845 ntTSL 1 (best)10.94□□□□□ -0.663e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-201ENST00000303660 3913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.743e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-216ENST00000465308 1071 ntTSL 59.97□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-208ENST00000434448 583 ntTSL 59.97□□□□□ -0.813e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-211ENST00000444559 577 ntTSL 49.85□□□□□ -0.833e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-236ENST00000636471 9583 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.853e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-210ENST00000440875 1809 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.883e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-205ENST00000419938 1755 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.923e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-206ENST00000427902 2236 ntTSL 1 (best)9.03□□□□□ -0.963e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-240ENST00000637267 2677 ntTSL 58.51□□□□□ -1.053e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-203ENST00000409211 587 ntTSL 47.85□□□□□ -1.153e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-232ENST00000636026 5172 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.163e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.473e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-213ENST00000461784 751 ntTSL 34.86□□□□□ -1.633e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-218ENST00000472146 3837 ntTSL 1 (best)4.61□□□□□ -1.673e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 ZEB2-242ENST00000637591 101 ntTSL 52.79□□□□□ -1.963e-6■■■■■ 40.8
FMR1Q06787 GABRE-203ENST00000441219 1324 ntTSL 212.28□□□□□ -0.443e-12■■■■■ 40.7
FMR1Q06787 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.93e-12■■■■■ 40.7
FMR1Q06787 IQGAP1-208ENST00000559809 1201 ntTSL 318.44■□□□□ 0.543e-8■■■■■ 40.7
FMR1Q06787 PDCD10-212ENST00000483451 1119 ntTSL 525.25■■□□□ 1.635e-11■■■■■ 40.4
FMR1Q06787 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.625e-11■■■■■ 40.4
FMR1Q06787 PDCD10-203ENST00000462725 715 ntTSL 523.71■■□□□ 1.395e-11■■■■■ 40.4
FMR1Q06787 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.085e-11■■■■■ 40.4
FMR1Q06787 PDCD10-211ENST00000481136 674 ntTSL 214.35□□□□□ -0.115e-11■■■■■ 40.4
FMR1Q06787 PDCD10-208ENST00000473645 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.385e-11■■■■■ 40.4
FMR1Q06787 PDCD10-217ENST00000494502 757 ntTSL 512.25□□□□□ -0.455e-11■■■■■ 40.4
FMR1Q06787 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.595e-11■■■■■ 40.4
FMR1Q06787 PDCD10-218ENST00000497056 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.685e-11■■■■■ 40.4
FMR1Q06787 PDCD10-209ENST00000475915 849 ntTSL 510.15□□□□□ -0.785e-11■■■■■ 40.4
FMR1Q06787 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.785e-11■■■■■ 40.4
FMR1Q06787 PDCD10-213ENST00000487678 416 ntTSL 39.42□□□□□ -0.95e-11■■■■■ 40.4
FMR1Q06787 PDCD10-205ENST00000464360 585 ntTSL 39.07□□□□□ -0.965e-11■■■■■ 40.4
FMR1Q06787 PDCD10-215ENST00000492139 686 ntTSL 58.36□□□□□ -1.075e-11■■■■■ 40.4
FMR1Q06787 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.195e-11■■■■■ 40.4
FMR1Q06787 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.25e-11■■■■■ 40.4
FMR1Q06787 ATP5J2-PTCD1-202ENST00000437572 544 ntTSL 420.13■□□□□ 0.812e-11■■■■■ 40.2
FMR1Q06787 ATP5J2-PTCD1-203ENST00000451138 331 ntTSL 419.52■□□□□ 0.722e-11■■■■■ 40.2
FMR1Q06787 PTCD1-204ENST00000430982 571 ntTSL 419.5■□□□□ 0.712e-11■■■■■ 40.2
FMR1Q06787 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.232e-11■■■■■ 40.2
FMR1Q06787 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.162e-11■■■■■ 40.2
FMR1Q06787 IST1-205ENST00000439924 1841 ntTSL 515.11■□□□□ 0.012e-11■■■■■ 40.2
FMR1Q06787 ATP5J2-206ENST00000466753 774 ntTSL 215.05■□□□□ -02e-11■■■■■ 40.2
FMR1Q06787 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.172e-11■■■■■ 40.2
FMR1Q06787 ZNF473-205ENST00000595661 4828 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.242e-11■■■■■ 40.2
FMR1Q06787 ATP5J2-204ENST00000414062 541 ntTSL 413.36□□□□□ -0.272e-11■■■■■ 40.2
FMR1Q06787 INMT-MINDY4-202ENST00000458257 2877 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.312e-11■■■■■ 40.2
FMR1Q06787 IST1-201ENST00000329908 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.352e-11■■■■■ 40.2
FMR1Q06787 IST1-202ENST00000378798 2255 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.432e-11■■■■■ 40.2
FMR1Q06787 ZNF473-209ENST00000601364 603 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.62e-11■■■■■ 40.2
FMR1Q06787 MYEOV-210ENST00000541137 876 ntTSL 310.5□□□□□ -0.738e-8■■■■■ 40.2
FMR1Q06787 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.772e-11■■■■■ 40.2
FMR1Q06787 MYEOV-212ENST00000544781 585 ntTSL 210.23□□□□□ -0.778e-8■■■■■ 40.2
FMR1Q06787 ATP5J2-202ENST00000359832 323 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.772e-11■■■■■ 40.2
FMR1Q06787 IST1-226ENST00000606369 3583 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.772e-11■■■■■ 40.2
FMR1Q06787 IST1-208ENST00000535424 4082 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.982e-11■■■■■ 40.2
FMR1Q06787 MYEOV-208ENST00000540356 442 ntTSL 38.84□□□□□ -0.998e-8■■■■■ 40.2
FMR1Q06787 HECTD4-201ENST00000311694 2734 ntTSL 28.83□□□□□ -12e-11■■■■■ 40.2
FMR1Q06787 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.022e-11■■■■■ 40.2
FMR1Q06787 ATP5J2-210ENST00000491560 658 ntTSL 26.74□□□□□ -1.332e-11■■■■■ 40.2
FMR1Q06787 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.492e-11■■■■■ 40.2
FMR1Q06787 RANBP2-202ENST00000425282 367 ntTSL 523.68■■□□□ 1.382e-7■■■■■ 40.1
FMR1Q06787 PRKDC-206ENST00000536429 659 ntTSL 316.51■□□□□ 0.232e-9■■■■■ 39.9
FMR1Q06787 DDX54-210ENST00000552375 780 ntTSL 517.74■□□□□ 0.439e-11■■■■■ 39.8
FMR1Q06787 DDX54-203ENST00000546869 420 ntTSL 317.58■□□□□ 0.49e-11■■■■■ 39.8
FMR1Q06787 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 39.8
FMR1Q06787 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.043e-6■■■■■ 39.8
FMR1Q06787 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 39.8
FMR1Q06787 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.473e-10■■■■■ 39.6
FMR1Q06787 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 39.6
FMR1Q06787 LINC00470-211ENST00000584492 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 03e-10■■■■■ 39.6
FMR1Q06787 LINC00470-203ENST00000577867 1211 ntTSL 1 (best)14.34□□□□□ -0.113e-10■■■■■ 39.6
FMR1Q06787 LINC00470-201ENST00000412816 2031 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.633e-10■■■■■ 39.6
FMR1Q06787 LINC00470-207ENST00000581430 556 ntTSL 510.06□□□□□ -0.83e-10■■■■■ 39.6
FMR1Q06787 LINC00470-204ENST00000578835 674 ntTSL 29.05□□□□□ -0.963e-10■■■■■ 39.6
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 136.8 ms