Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBQ06643 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LTBQ06643 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBQ06643 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBQ06643 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBQ06643 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBQ06643 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBQ06643 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBQ06643 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LTBQ06643 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBQ06643 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBQ06643 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBQ06643 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBQ06643 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LTBQ06643 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBQ06643 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBQ06643 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBQ06643 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBQ06643 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBQ06643 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBQ06643 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LTBQ06643 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBQ06643 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBQ06643 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LTBQ06643 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LTBQ06643 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBQ06643 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBQ06643 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBQ06643 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBQ06643 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBQ06643 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBQ06643 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBQ06643 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBQ06643 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBQ06643 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBQ06643 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LTBQ06643 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LTBQ06643 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LTBQ06643 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBQ06643 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBQ06643 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBQ06643 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBQ06643 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBQ06643 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBQ06643 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBQ06643 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBQ06643 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBQ06643 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LTBQ06643 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBQ06643 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBQ06643 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LTBQ06643 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBQ06643 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBQ06643 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBQ06643 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBQ06643 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBQ06643 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBQ06643 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LTBQ06643 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBQ06643 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBQ06643 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBQ06643 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBQ06643 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LTBQ06643 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBQ06643 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBQ06643 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBQ06643 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBQ06643 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LTBQ06643 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBQ06643 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBQ06643 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBQ06643 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBQ06643 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LTBQ06643 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBQ06643 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBQ06643 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBQ06643 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LTBQ06643 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBQ06643 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBQ06643 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBQ06643 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBQ06643 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBQ06643 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBQ06643 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBQ06643 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LTBQ06643 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBQ06643 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBQ06643 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBQ06643 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LTBQ06643 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBQ06643 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBQ06643 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LTBQ06643 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBQ06643 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBQ06643 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBQ06643 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBQ06643 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBQ06643 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LTBQ06643 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LTBQ06643 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms