Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABPB1Q06547 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GABPB1Q06547 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABPB1Q06547 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABPB1Q06547 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABPB1Q06547 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABPB1Q06547 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GABPB1Q06547 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABPB1Q06547 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABPB1Q06547 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GABPB1Q06547 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GABPB1Q06547 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GABPB1Q06547 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GABPB1Q06547 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GABPB1Q06547 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GABPB1Q06547 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GABPB1Q06547 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GABPB1Q06547 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GABPB1Q06547 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GABPB1Q06547 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABPB1Q06547 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABPB1Q06547 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABPB1Q06547 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABPB1Q06547 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABPB1Q06547 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GABPB1Q06547 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABPB1Q06547 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GABPB1Q06547 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABPB1Q06547 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABPB1Q06547 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABPB1Q06547 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GABPB1Q06547 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABPB1Q06547 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABPB1Q06547 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABPB1Q06547 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABPB1Q06547 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABPB1Q06547 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABPB1Q06547 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABPB1Q06547 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABPB1Q06547 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABPB1Q06547 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABPB1Q06547 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABPB1Q06547 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GABPB1Q06547 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GABPB1Q06547 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABPB1Q06547 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms