Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKCDQ05655 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKCDQ05655 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRKCDQ05655 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRKCDQ05655 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms