Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC37.88■■■■□ 3.66
ATP7AQ04656 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
ATP7AQ04656 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ATP7AQ04656 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
ATP7AQ04656 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ATP7AQ04656 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
ATP7AQ04656 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
ATP7AQ04656 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
ATP7AQ04656 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
ATP7AQ04656 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
ATP7AQ04656 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ATP7AQ04656 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
ATP7AQ04656 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
ATP7AQ04656 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
ATP7AQ04656 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
ATP7AQ04656 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.64
ATP7AQ04656 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
ATP7AQ04656 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
ATP7AQ04656 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
ATP7AQ04656 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
ATP7AQ04656 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC37.8■■■■□ 3.64
ATP7AQ04656 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
ATP7AQ04656 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ATP7AQ04656 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ATP7AQ04656 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
ATP7AQ04656 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
ATP7AQ04656 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
ATP7AQ04656 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
ATP7AQ04656 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC37.77■■■■□ 3.64
ATP7AQ04656 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
ATP7AQ04656 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
ATP7AQ04656 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
ATP7AQ04656 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
ATP7AQ04656 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
ATP7AQ04656 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
ATP7AQ04656 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
ATP7AQ04656 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
ATP7AQ04656 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ATP7AQ04656 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ATP7AQ04656 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
ATP7AQ04656 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
ATP7AQ04656 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.74■■■■□ 3.63
ATP7AQ04656 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
ATP7AQ04656 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ATP7AQ04656 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
ATP7AQ04656 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
ATP7AQ04656 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
ATP7AQ04656 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
ATP7AQ04656 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
ATP7AQ04656 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
ATP7AQ04656 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ATP7AQ04656 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ATP7AQ04656 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
ATP7AQ04656 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC37.68■■■■□ 3.62
ATP7AQ04656 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
ATP7AQ04656 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
ATP7AQ04656 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
ATP7AQ04656 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
ATP7AQ04656 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ATP7AQ04656 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ATP7AQ04656 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
ATP7AQ04656 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ATP7AQ04656 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
ATP7AQ04656 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
ATP7AQ04656 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
ATP7AQ04656 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ATP7AQ04656 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ATP7AQ04656 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
ATP7AQ04656 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
ATP7AQ04656 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
ATP7AQ04656 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
ATP7AQ04656 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
ATP7AQ04656 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
ATP7AQ04656 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ATP7AQ04656 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ATP7AQ04656 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ATP7AQ04656 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ATP7AQ04656 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ATP7AQ04656 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms