Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RELAQ04206 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RELAQ04206 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RELAQ04206 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RELAQ04206 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RELAQ04206 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RELAQ04206 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RELAQ04206 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RELAQ04206 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RELAQ04206 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RELAQ04206 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RELAQ04206 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RELAQ04206 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RELAQ04206 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RELAQ04206 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RELAQ04206 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RELAQ04206 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RELAQ04206 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RELAQ04206 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RELAQ04206 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RELAQ04206 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RELAQ04206 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RELAQ04206 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RELAQ04206 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RELAQ04206 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RELAQ04206 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RELAQ04206 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RELAQ04206 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RELAQ04206 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RELAQ04206 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RELAQ04206 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RELAQ04206 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RELAQ04206 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RELAQ04206 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RELAQ04206 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RELAQ04206 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RELAQ04206 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RELAQ04206 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RELAQ04206 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RELAQ04206 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RELAQ04206 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RELAQ04206 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RELAQ04206 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RELAQ04206 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RELAQ04206 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RELAQ04206 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RELAQ04206 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RELAQ04206 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RELAQ04206 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RELAQ04206 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RELAQ04206 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RELAQ04206 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RELAQ04206 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RELAQ04206 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RELAQ04206 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RELAQ04206 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RELAQ04206 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RELAQ04206 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RELAQ04206 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RELAQ04206 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RELAQ04206 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RELAQ04206 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RELAQ04206 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RELAQ04206 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RELAQ04206 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RELAQ04206 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RELAQ04206 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RELAQ04206 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RELAQ04206 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RELAQ04206 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RELAQ04206 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RELAQ04206 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RELAQ04206 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RELAQ04206 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RELAQ04206 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RELAQ04206 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RELAQ04206 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RELAQ04206 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RELAQ04206 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RELAQ04206 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RELAQ04206 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RELAQ04206 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RELAQ04206 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RELAQ04206 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RELAQ04206 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RELAQ04206 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RELAQ04206 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RELAQ04206 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RELAQ04206 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RELAQ04206 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RELAQ04206 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RELAQ04206 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RELAQ04206 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RELAQ04206 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RELAQ04206 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RELAQ04206 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RELAQ04206 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RELAQ04206 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RELAQ04206 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RELAQ04206 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms