Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPCQ03188 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CENPCQ03188 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPCQ03188 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPCQ03188 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CENPCQ03188 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPCQ03188 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CENPCQ03188 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPCQ03188 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPCQ03188 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CENPCQ03188 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPCQ03188 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPCQ03188 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPCQ03188 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPCQ03188 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPCQ03188 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPCQ03188 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPCQ03188 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPCQ03188 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CENPCQ03188 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CENPCQ03188 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CENPCQ03188 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CENPCQ03188 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms