Protein–RNA interactions for Protein: Q00722

PLCB2, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB2Q00722 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PLCB2Q00722 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLCB2Q00722 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLCB2Q00722 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PLCB2Q00722 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLCB2Q00722 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PLCB2Q00722 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLCB2Q00722 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLCB2Q00722 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLCB2Q00722 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PLCB2Q00722 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLCB2Q00722 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PLCB2Q00722 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
PLCB2Q00722 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PLCB2Q00722 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PLCB2Q00722 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PLCB2Q00722 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PLCB2Q00722 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PLCB2Q00722 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms