Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FGD1P98174 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FGD1P98174 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FGD1P98174 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FGD1P98174 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FGD1P98174 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FGD1P98174 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FGD1P98174 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FGD1P98174 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FGD1P98174 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FGD1P98174 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FGD1P98174 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FGD1P98174 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FGD1P98174 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FGD1P98174 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FGD1P98174 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FGD1P98174 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FGD1P98174 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FGD1P98174 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FGD1P98174 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FGD1P98174 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FGD1P98174 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FGD1P98174 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FGD1P98174 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FGD1P98174 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FGD1P98174 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FGD1P98174 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FGD1P98174 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FGD1P98174 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FGD1P98174 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FGD1P98174 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FGD1P98174 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FGD1P98174 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FGD1P98174 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FGD1P98174 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FGD1P98174 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FGD1P98174 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FGD1P98174 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FGD1P98174 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FGD1P98174 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGD1P98174 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGD1P98174 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGD1P98174 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FGD1P98174 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FGD1P98174 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FGD1P98174 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
FGD1P98174 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FGD1P98174 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
FGD1P98174 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
FGD1P98174 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
FGD1P98174 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
FGD1P98174 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FGD1P98174 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FGD1P98174 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
FGD1P98174 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
FGD1P98174 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
FGD1P98174 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FGD1P98174 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FGD1P98174 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FGD1P98174 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FGD1P98174 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FGD1P98174 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
FGD1P98174 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
FGD1P98174 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
FGD1P98174 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FGD1P98174 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
FGD1P98174 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
FGD1P98174 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
FGD1P98174 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FGD1P98174 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
FGD1P98174 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
FGD1P98174 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
FGD1P98174 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FGD1P98174 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
FGD1P98174 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FGD1P98174 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FGD1P98174 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
FGD1P98174 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FGD1P98174 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
FGD1P98174 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FGD1P98174 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FGD1P98174 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FGD1P98174 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FGD1P98174 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
FGD1P98174 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
FGD1P98174 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
FGD1P98174 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FGD1P98174 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FGD1P98174 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
FGD1P98174 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
FGD1P98174 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD1P98174 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
FGD1P98174 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGD1P98174 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
FGD1P98174 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGD1P98174 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
FGD1P98174 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGD1P98174 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGD1P98174 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
FGD1P98174 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms