Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IRX3P78415 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
IRX3P78415 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
IRX3P78415 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IRX3P78415 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IRX3P78415 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRX3P78415 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRX3P78415 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRX3P78415 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRX3P78415 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IRX3P78415 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IRX3P78415 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IRX3P78415 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IRX3P78415 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IRX3P78415 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IRX3P78415 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IRX3P78415 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IRX3P78415 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IRX3P78415 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IRX3P78415 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IRX3P78415 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IRX3P78415 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IRX3P78415 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IRX3P78415 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IRX3P78415 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IRX3P78415 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IRX3P78415 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IRX3P78415 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IRX3P78415 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IRX3P78415 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IRX3P78415 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IRX3P78415 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IRX3P78415 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IRX3P78415 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IRX3P78415 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IRX3P78415 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IRX3P78415 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IRX3P78415 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IRX3P78415 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IRX3P78415 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
IRX3P78415 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
IRX3P78415 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IRX3P78415 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IRX3P78415 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IRX3P78415 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
IRX3P78415 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IRX3P78415 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
IRX3P78415 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
IRX3P78415 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
IRX3P78415 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
IRX3P78415 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IRX3P78415 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IRX3P78415 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
IRX3P78415 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
IRX3P78415 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IRX3P78415 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IRX3P78415 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
IRX3P78415 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IRX3P78415 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IRX3P78415 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
IRX3P78415 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IRX3P78415 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IRX3P78415 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IRX3P78415 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IRX3P78415 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IRX3P78415 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IRX3P78415 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IRX3P78415 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
IRX3P78415 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
IRX3P78415 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
IRX3P78415 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
IRX3P78415 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IRX3P78415 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
IRX3P78415 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
IRX3P78415 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IRX3P78415 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IRX3P78415 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
IRX3P78415 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
IRX3P78415 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
IRX3P78415 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IRX3P78415 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
IRX3P78415 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IRX3P78415 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IRX3P78415 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IRX3P78415 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
IRX3P78415 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
IRX3P78415 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
IRX3P78415 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
IRX3P78415 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
IRX3P78415 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
IRX3P78415 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
IRX3P78415 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
IRX3P78415 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
IRX3P78415 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRX3P78415 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRX3P78415 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRX3P78415 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRX3P78415 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRX3P78415 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
IRX3P78415 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms