Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ASIC1P78348 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ASIC1P78348 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ASIC1P78348 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ASIC1P78348 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ASIC1P78348 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ASIC1P78348 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ASIC1P78348 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ASIC1P78348 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ASIC1P78348 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ASIC1P78348 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ASIC1P78348 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ASIC1P78348 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ASIC1P78348 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ASIC1P78348 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ASIC1P78348 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ASIC1P78348 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ASIC1P78348 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ASIC1P78348 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ASIC1P78348 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ASIC1P78348 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ASIC1P78348 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ASIC1P78348 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ASIC1P78348 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ASIC1P78348 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ASIC1P78348 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ASIC1P78348 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ASIC1P78348 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ASIC1P78348 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ASIC1P78348 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ASIC1P78348 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ASIC1P78348 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ASIC1P78348 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ASIC1P78348 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ASIC1P78348 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ASIC1P78348 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ASIC1P78348 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ASIC1P78348 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ASIC1P78348 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ASIC1P78348 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ASIC1P78348 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ASIC1P78348 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ASIC1P78348 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ASIC1P78348 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ASIC1P78348 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ASIC1P78348 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ASIC1P78348 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ASIC1P78348 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ASIC1P78348 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ASIC1P78348 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ASIC1P78348 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ASIC1P78348 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ASIC1P78348 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ASIC1P78348 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ASIC1P78348 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ASIC1P78348 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ASIC1P78348 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ASIC1P78348 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ASIC1P78348 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ASIC1P78348 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms