Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB1AP62820 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB1AP62820 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAB1AP62820 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB1AP62820 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms