Protein–RNA interactions for Protein: P62310

LSM3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM3P62310 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM3P62310 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM3P62310 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LSM3P62310 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM3P62310 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM3P62310 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM3P62310 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM3P62310 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM3P62310 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM3P62310 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM3P62310 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LSM3P62310 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM3P62310 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM3P62310 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM3P62310 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM3P62310 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM3P62310 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM3P62310 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM3P62310 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM3P62310 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LSM3P62310 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM3P62310 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM3P62310 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM3P62310 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LSM3P62310 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM3P62310 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM3P62310 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM3P62310 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM3P62310 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM3P62310 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM3P62310 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LSM3P62310 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LSM3P62310 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM3P62310 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LSM3P62310 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM3P62310 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM3P62310 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM3P62310 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM3P62310 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LSM3P62310 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM3P62310 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM3P62310 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LSM3P62310 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM3P62310 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM3P62310 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM3P62310 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM3P62310 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM3P62310 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LSM3P62310 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM3P62310 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM3P62310 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LSM3P62310 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM3P62310 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM3P62310 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM3P62310 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM3P62310 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LSM3P62310 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM3P62310 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM3P62310 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM3P62310 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LSM3P62310 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LSM3P62310 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM3P62310 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM3P62310 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LSM3P62310 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM3P62310 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM3P62310 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM3P62310 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM3P62310 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM3P62310 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM3P62310 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LSM3P62310 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM3P62310 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM3P62310 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LSM3P62310 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM3P62310 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM3P62310 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM3P62310 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM3P62310 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM3P62310 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LSM3P62310 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM3P62310 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM3P62310 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM3P62310 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM3P62310 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM3P62310 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM3P62310 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM3P62310 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM3P62310 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM3P62310 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM3P62310 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LSM3P62310 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM3P62310 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM3P62310 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM3P62310 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LSM3P62310 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
LSM3P62310 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM3P62310 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM3P62310 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LSM3P62310 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms