Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP46P62068 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP46P62068 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP46P62068 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP46P62068 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP46P62068 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP46P62068 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP46P62068 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP46P62068 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
USP46P62068 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
USP46P62068 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP46P62068 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP46P62068 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP46P62068 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP46P62068 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP46P62068 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP46P62068 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP46P62068 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP46P62068 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
USP46P62068 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP46P62068 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP46P62068 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP46P62068 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP46P62068 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP46P62068 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP46P62068 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP46P62068 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP46P62068 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP46P62068 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP46P62068 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP46P62068 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP46P62068 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
USP46P62068 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP46P62068 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
USP46P62068 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
USP46P62068 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP46P62068 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP46P62068 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP46P62068 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP46P62068 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP46P62068 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
USP46P62068 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP46P62068 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP46P62068 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP46P62068 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP46P62068 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP46P62068 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP46P62068 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP46P62068 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP46P62068 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP46P62068 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP46P62068 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP46P62068 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP46P62068 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP46P62068 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP46P62068 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP46P62068 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP46P62068 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP46P62068 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP46P62068 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP46P62068 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
USP46P62068 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
USP46P62068 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP46P62068 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP46P62068 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP46P62068 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP46P62068 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP46P62068 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP46P62068 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP46P62068 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP46P62068 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP46P62068 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP46P62068 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP46P62068 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP46P62068 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP46P62068 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP46P62068 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP46P62068 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP46P62068 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP46P62068 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
USP46P62068 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP46P62068 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
USP46P62068 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP46P62068 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
USP46P62068 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP46P62068 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
USP46P62068 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP46P62068 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
USP46P62068 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP46P62068 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP46P62068 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP46P62068 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP46P62068 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
USP46P62068 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
USP46P62068 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP46P62068 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP46P62068 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP46P62068 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP46P62068 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
USP46P62068 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms