Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTENP60484 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTENP60484 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTENP60484 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTENP60484 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTENP60484 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTENP60484 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTENP60484 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTENP60484 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTENP60484 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTENP60484 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTENP60484 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTENP60484 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTENP60484 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTENP60484 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTENP60484 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTENP60484 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTENP60484 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTENP60484 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTENP60484 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PTENP60484 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTENP60484 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTENP60484 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PTENP60484 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTENP60484 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PTENP60484 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTENP60484 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTENP60484 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTENP60484 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTENP60484 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PTENP60484 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTENP60484 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PTENP60484 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTENP60484 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PTENP60484 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PTENP60484 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PTENP60484 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTENP60484 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTENP60484 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTENP60484 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTENP60484 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTENP60484 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTENP60484 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PTENP60484 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PTENP60484 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTENP60484 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTENP60484 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTENP60484 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PTENP60484 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTENP60484 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTENP60484 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTENP60484 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTENP60484 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTENP60484 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTENP60484 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTENP60484 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTENP60484 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PTENP60484 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTENP60484 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTENP60484 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTENP60484 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PTENP60484 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PTENP60484 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTENP60484 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTENP60484 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTENP60484 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTENP60484 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTENP60484 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTENP60484 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTENP60484 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PTENP60484 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTENP60484 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTENP60484 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTENP60484 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTENP60484 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTENP60484 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTENP60484 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTENP60484 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTENP60484 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTENP60484 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTENP60484 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTENP60484 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTENP60484 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTENP60484 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTENP60484 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTENP60484 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTENP60484 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTENP60484 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTENP60484 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTENP60484 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTENP60484 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTENP60484 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTENP60484 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTENP60484 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTENP60484 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTENP60484 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTENP60484 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTENP60484 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTENP60484 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTENP60484 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1077.7 ms