Protein–RNA interactions for Protein: P59990

KRTAP12-1, Keratin-associated protein 12-1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP12-1P59990 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP12-1P59990 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP12-1P59990 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP12-1P59990 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP12-1P59990 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP12-1P59990 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP12-1P59990 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP12-1P59990 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
KRTAP12-1P59990 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP12-1P59990 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP12-1P59990 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP12-1P59990 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP12-1P59990 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP12-1P59990 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP12-1P59990 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP12-1P59990 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP12-1P59990 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP12-1P59990 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP12-1P59990 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP12-1P59990 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP12-1P59990 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP12-1P59990 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms