Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
GJA9P57773 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJA9P57773 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJA9P57773 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJA9P57773 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJA9P57773 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
GJA9P57773 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA9P57773 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA9P57773 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA9P57773 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA9P57773 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA9P57773 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA9P57773 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA9P57773 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA9P57773 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA9P57773 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA9P57773 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA9P57773 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
GJA9P57773 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA9P57773 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA9P57773 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA9P57773 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA9P57773 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
GJA9P57773 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA9P57773 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA9P57773 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
GJA9P57773 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJA9P57773 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
GJA9P57773 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA9P57773 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA9P57773 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GJA9P57773 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA9P57773 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA9P57773 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA9P57773 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA9P57773 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA9P57773 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA9P57773 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
GJA9P57773 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJA9P57773 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJA9P57773 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJA9P57773 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GJA9P57773 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA9P57773 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA9P57773 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA9P57773 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA9P57773 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA9P57773 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA9P57773 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GJA9P57773 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA9P57773 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA9P57773 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA9P57773 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA9P57773 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA9P57773 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GJA9P57773 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA9P57773 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA9P57773 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GJA9P57773 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GJA9P57773 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GJA9P57773 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GJA9P57773 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GJA9P57773 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJA9P57773 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJA9P57773 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJA9P57773 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJA9P57773 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GJA9P57773 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJA9P57773 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GJA9P57773 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJA9P57773 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJA9P57773 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
GJA9P57773 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJA9P57773 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GJA9P57773 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJA9P57773 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJA9P57773 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJA9P57773 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJA9P57773 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJA9P57773 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GJA9P57773 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJA9P57773 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
GJA9P57773 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GJA9P57773 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJA9P57773 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJA9P57773 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJA9P57773 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
GJA9P57773 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJA9P57773 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GJA9P57773 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJA9P57773 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJA9P57773 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GJA9P57773 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJA9P57773 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJA9P57773 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
GJA9P57773 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GJA9P57773 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJA9P57773 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJA9P57773 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GJA9P57773 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms