Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NRG3P56975 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRG3P56975 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRG3P56975 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRG3P56975 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NRG3P56975 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRG3P56975 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRG3P56975 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NRG3P56975 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRG3P56975 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRG3P56975 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRG3P56975 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NRG3P56975 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRG3P56975 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRG3P56975 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRG3P56975 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NRG3P56975 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRG3P56975 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRG3P56975 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NRG3P56975 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
NRG3P56975 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
NRG3P56975 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NRG3P56975 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NRG3P56975 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NRG3P56975 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NRG3P56975 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRG3P56975 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NRG3P56975 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRG3P56975 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRG3P56975 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRG3P56975 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRG3P56975 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRG3P56975 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRG3P56975 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRG3P56975 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRG3P56975 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRG3P56975 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRG3P56975 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRG3P56975 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRG3P56975 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NRG3P56975 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NRG3P56975 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NRG3P56975 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRG3P56975 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRG3P56975 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NRG3P56975 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NRG3P56975 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRG3P56975 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRG3P56975 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NRG3P56975 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRG3P56975 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRG3P56975 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRG3P56975 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRG3P56975 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRG3P56975 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NRG3P56975 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NRG3P56975 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NRG3P56975 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRG3P56975 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRG3P56975 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRG3P56975 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRG3P56975 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRG3P56975 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NRG3P56975 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRG3P56975 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRG3P56975 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRG3P56975 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRG3P56975 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRG3P56975 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NRG3P56975 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRG3P56975 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRG3P56975 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRG3P56975 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRG3P56975 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRG3P56975 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NRG3P56975 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRG3P56975 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRG3P56975 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRG3P56975 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NRG3P56975 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG3P56975 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG3P56975 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG3P56975 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG3P56975 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG3P56975 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NRG3P56975 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRG3P56975 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRG3P56975 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRG3P56975 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NRG3P56975 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRG3P56975 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRG3P56975 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRG3P56975 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NRG3P56975 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRG3P56975 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRG3P56975 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRG3P56975 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRG3P56975 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRG3P56975 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NRG3P56975 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms