Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SUMO3P55854 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUMO3P55854 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUMO3P55854 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms