Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3BGRP55822 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3BGRP55822 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3BGRP55822 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SH3BGRP55822 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms