Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ATXN1P54253 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATXN1P54253 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATXN1P54253 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATXN1P54253 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATXN1P54253 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATXN1P54253 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATXN1P54253 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATXN1P54253 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATXN1P54253 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATXN1P54253 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATXN1P54253 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATXN1P54253 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATXN1P54253 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATXN1P54253 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATXN1P54253 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATXN1P54253 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATXN1P54253 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATXN1P54253 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATXN1P54253 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATXN1P54253 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms