Protein–RNA interactions for Protein: P53816

PLA2G16, HRAS-like suppressor 3, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G16P53816 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLA2G16P53816 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLA2G16P53816 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PLA2G16P53816 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PLA2G16P53816 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLA2G16P53816 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLA2G16P53816 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLA2G16P53816 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLA2G16P53816 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PLA2G16P53816 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PLA2G16P53816 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PLA2G16P53816 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLA2G16P53816 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PLA2G16P53816 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PLA2G16P53816 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PLA2G16P53816 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLA2G16P53816 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLA2G16P53816 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLA2G16P53816 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLA2G16P53816 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PLA2G16P53816 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PLA2G16P53816 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLA2G16P53816 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLA2G16P53816 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLA2G16P53816 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PLA2G16P53816 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLA2G16P53816 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLA2G16P53816 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLA2G16P53816 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLA2G16P53816 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLA2G16P53816 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLA2G16P53816 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLA2G16P53816 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLA2G16P53816 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PLA2G16P53816 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLA2G16P53816 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLA2G16P53816 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms