Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
COPAP53621 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COPAP53621 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COPAP53621 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COPAP53621 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
COPAP53621 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COPAP53621 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COPAP53621 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COPAP53621 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COPAP53621 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
COPAP53621 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPAP53621 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPAP53621 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPAP53621 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPAP53621 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COPAP53621 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COPAP53621 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COPAP53621 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPAP53621 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPAP53621 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
COPAP53621 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COPAP53621 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COPAP53621 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
COPAP53621 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPAP53621 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPAP53621 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
COPAP53621 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPAP53621 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPAP53621 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPAP53621 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPAP53621 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPAP53621 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPAP53621 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPAP53621 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPAP53621 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPAP53621 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPAP53621 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPAP53621 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPAP53621 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPAP53621 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
COPAP53621 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPAP53621 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPAP53621 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPAP53621 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPAP53621 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPAP53621 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPAP53621 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPAP53621 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPAP53621 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPAP53621 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPAP53621 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPAP53621 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPAP53621 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPAP53621 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPAP53621 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPAP53621 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPAP53621 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPAP53621 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPAP53621 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPAP53621 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPAP53621 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPAP53621 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COPAP53621 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COPAP53621 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COPAP53621 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPAP53621 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPAP53621 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPAP53621 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPAP53621 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPAP53621 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPAP53621 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPAP53621 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
COPAP53621 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPAP53621 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPAP53621 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPAP53621 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPAP53621 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPAP53621 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COPAP53621 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
COPAP53621 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
COPAP53621 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
COPAP53621 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPAP53621 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPAP53621 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPAP53621 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPAP53621 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COPAP53621 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPAP53621 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPAP53621 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPAP53621 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COPAP53621 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPAP53621 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPAP53621 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
COPAP53621 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPAP53621 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COPAP53621 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPAP53621 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPAP53621 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPAP53621 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COPAP53621 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms