Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
THOP1P52888 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
THOP1P52888 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
THOP1P52888 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
THOP1P52888 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
THOP1P52888 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
THOP1P52888 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
THOP1P52888 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
THOP1P52888 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THOP1P52888 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
THOP1P52888 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THOP1P52888 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THOP1P52888 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
THOP1P52888 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
THOP1P52888 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
THOP1P52888 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
THOP1P52888 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
THOP1P52888 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
THOP1P52888 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
THOP1P52888 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
THOP1P52888 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
THOP1P52888 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
THOP1P52888 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THOP1P52888 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THOP1P52888 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
THOP1P52888 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THOP1P52888 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THOP1P52888 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THOP1P52888 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
THOP1P52888 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
THOP1P52888 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
THOP1P52888 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
THOP1P52888 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
THOP1P52888 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
THOP1P52888 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
THOP1P52888 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
THOP1P52888 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
THOP1P52888 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
THOP1P52888 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THOP1P52888 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THOP1P52888 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
THOP1P52888 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THOP1P52888 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
THOP1P52888 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
THOP1P52888 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THOP1P52888 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THOP1P52888 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THOP1P52888 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THOP1P52888 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THOP1P52888 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THOP1P52888 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THOP1P52888 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THOP1P52888 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THOP1P52888 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.6
THOP1P52888 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
THOP1P52888 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THOP1P52888 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THOP1P52888 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THOP1P52888 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THOP1P52888 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THOP1P52888 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THOP1P52888 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THOP1P52888 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THOP1P52888 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THOP1P52888 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
THOP1P52888 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
THOP1P52888 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
THOP1P52888 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
THOP1P52888 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
THOP1P52888 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
THOP1P52888 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
THOP1P52888 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
THOP1P52888 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THOP1P52888 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
THOP1P52888 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
THOP1P52888 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THOP1P52888 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THOP1P52888 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
THOP1P52888 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THOP1P52888 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
THOP1P52888 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
THOP1P52888 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THOP1P52888 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THOP1P52888 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THOP1P52888 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THOP1P52888 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
THOP1P52888 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THOP1P52888 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THOP1P52888 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THOP1P52888 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THOP1P52888 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THOP1P52888 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THOP1P52888 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THOP1P52888 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THOP1P52888 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THOP1P52888 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THOP1P52888 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THOP1P52888 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
THOP1P52888 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
THOP1P52888 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms