Protein–RNA interactions for Protein: P52292

KPNA2, Importin subunit alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA2P52292 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KPNA2P52292 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KPNA2P52292 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KPNA2P52292 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KPNA2P52292 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KPNA2P52292 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KPNA2P52292 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KPNA2P52292 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KPNA2P52292 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KPNA2P52292 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KPNA2P52292 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KPNA2P52292 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KPNA2P52292 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KPNA2P52292 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KPNA2P52292 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KPNA2P52292 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KPNA2P52292 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KPNA2P52292 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KPNA2P52292 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KPNA2P52292 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KPNA2P52292 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KPNA2P52292 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KPNA2P52292 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KPNA2P52292 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KPNA2P52292 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KPNA2P52292 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KPNA2P52292 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KPNA2P52292 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KPNA2P52292 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KPNA2P52292 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KPNA2P52292 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KPNA2P52292 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KPNA2P52292 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KPNA2P52292 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KPNA2P52292 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KPNA2P52292 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KPNA2P52292 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KPNA2P52292 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KPNA2P52292 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KPNA2P52292 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KPNA2P52292 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KPNA2P52292 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KPNA2P52292 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KPNA2P52292 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms