Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DAP3P51398 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DAP3P51398 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DAP3P51398 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DAP3P51398 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DAP3P51398 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DAP3P51398 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DAP3P51398 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DAP3P51398 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DAP3P51398 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DAP3P51398 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DAP3P51398 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DAP3P51398 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DAP3P51398 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DAP3P51398 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DAP3P51398 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DAP3P51398 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DAP3P51398 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DAP3P51398 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DAP3P51398 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DAP3P51398 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DAP3P51398 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DAP3P51398 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DAP3P51398 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DAP3P51398 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DAP3P51398 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DAP3P51398 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DAP3P51398 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DAP3P51398 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DAP3P51398 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DAP3P51398 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DAP3P51398 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DAP3P51398 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DAP3P51398 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DAP3P51398 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DAP3P51398 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DAP3P51398 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DAP3P51398 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DAP3P51398 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DAP3P51398 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DAP3P51398 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DAP3P51398 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DAP3P51398 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DAP3P51398 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DAP3P51398 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DAP3P51398 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DAP3P51398 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DAP3P51398 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DAP3P51398 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DAP3P51398 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DAP3P51398 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DAP3P51398 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DAP3P51398 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DAP3P51398 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DAP3P51398 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DAP3P51398 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DAP3P51398 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DAP3P51398 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DAP3P51398 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DAP3P51398 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DAP3P51398 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DAP3P51398 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DAP3P51398 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DAP3P51398 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DAP3P51398 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DAP3P51398 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DAP3P51398 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DAP3P51398 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DAP3P51398 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DAP3P51398 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DAP3P51398 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DAP3P51398 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DAP3P51398 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DAP3P51398 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DAP3P51398 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DAP3P51398 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DAP3P51398 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DAP3P51398 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DAP3P51398 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DAP3P51398 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DAP3P51398 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DAP3P51398 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DAP3P51398 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DAP3P51398 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DAP3P51398 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DAP3P51398 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DAP3P51398 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DAP3P51398 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DAP3P51398 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DAP3P51398 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DAP3P51398 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DAP3P51398 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DAP3P51398 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DAP3P51398 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DAP3P51398 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DAP3P51398 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DAP3P51398 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DAP3P51398 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DAP3P51398 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DAP3P51398 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 398.1 ms