Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT8P50990 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT8P50990 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT8P50990 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT8P50990 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT8P50990 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT8P50990 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT8P50990 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT8P50990 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT8P50990 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT8P50990 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCT8P50990 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCT8P50990 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT8P50990 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT8P50990 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCT8P50990 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT8P50990 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT8P50990 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT8P50990 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT8P50990 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT8P50990 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT8P50990 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCT8P50990 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCT8P50990 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCT8P50990 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCT8P50990 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCT8P50990 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCT8P50990 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCT8P50990 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCT8P50990 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCT8P50990 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCT8P50990 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCT8P50990 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCT8P50990 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCT8P50990 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCT8P50990 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCT8P50990 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCT8P50990 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCT8P50990 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCT8P50990 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCT8P50990 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCT8P50990 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCT8P50990 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCT8P50990 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCT8P50990 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCT8P50990 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCT8P50990 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCT8P50990 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCT8P50990 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCT8P50990 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCT8P50990 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCT8P50990 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCT8P50990 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCT8P50990 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCT8P50990 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCT8P50990 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCT8P50990 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCT8P50990 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCT8P50990 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCT8P50990 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCT8P50990 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCT8P50990 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCT8P50990 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCT8P50990 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCT8P50990 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCT8P50990 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCT8P50990 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCT8P50990 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCT8P50990 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCT8P50990 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCT8P50990 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCT8P50990 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCT8P50990 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCT8P50990 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCT8P50990 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCT8P50990 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCT8P50990 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCT8P50990 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCT8P50990 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCT8P50990 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCT8P50990 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCT8P50990 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCT8P50990 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCT8P50990 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCT8P50990 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCT8P50990 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCT8P50990 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCT8P50990 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCT8P50990 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCT8P50990 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCT8P50990 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCT8P50990 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCT8P50990 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCT8P50990 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCT8P50990 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCT8P50990 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCT8P50990 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCT8P50990 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCT8P50990 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCT8P50990 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms