Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PEX5P50542 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PEX5P50542 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PEX5P50542 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PEX5P50542 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PEX5P50542 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PEX5P50542 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PEX5P50542 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PEX5P50542 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PEX5P50542 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PEX5P50542 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PEX5P50542 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PEX5P50542 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PEX5P50542 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PEX5P50542 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PEX5P50542 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PEX5P50542 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PEX5P50542 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PEX5P50542 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PEX5P50542 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PEX5P50542 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PEX5P50542 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PEX5P50542 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PEX5P50542 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PEX5P50542 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PEX5P50542 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PEX5P50542 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PEX5P50542 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PEX5P50542 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PEX5P50542 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PEX5P50542 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PEX5P50542 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PEX5P50542 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PEX5P50542 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PEX5P50542 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PEX5P50542 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PEX5P50542 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PEX5P50542 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PEX5P50542 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PEX5P50542 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PEX5P50542 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PEX5P50542 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PEX5P50542 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PEX5P50542 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEX5P50542 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEX5P50542 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEX5P50542 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEX5P50542 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEX5P50542 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEX5P50542 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX5P50542 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX5P50542 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX5P50542 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX5P50542 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX5P50542 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX5P50542 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX5P50542 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PEX5P50542 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX5P50542 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX5P50542 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX5P50542 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX5P50542 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX5P50542 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX5P50542 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX5P50542 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX5P50542 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX5P50542 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX5P50542 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX5P50542 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX5P50542 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX5P50542 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX5P50542 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX5P50542 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PEX5P50542 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PEX5P50542 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PEX5P50542 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PEX5P50542 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PEX5P50542 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PEX5P50542 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PEX5P50542 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PEX5P50542 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PEX5P50542 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PEX5P50542 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PEX5P50542 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PEX5P50542 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX5P50542 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX5P50542 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX5P50542 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX5P50542 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PEX5P50542 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PEX5P50542 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PEX5P50542 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PEX5P50542 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PEX5P50542 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PEX5P50542 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PEX5P50542 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PEX5P50542 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PEX5P50542 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PEX5P50542 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PEX5P50542 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 236.5 ms