Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PSEN1P49768 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PSEN1P49768 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
PSEN1P49768 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSEN1P49768 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSEN1P49768 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSEN1P49768 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSEN1P49768 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSEN1P49768 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSEN1P49768 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms