Protein–RNA interactions for Protein: P49019

HCAR3, Hydroxycarboxylic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCAR3P49019 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HCAR3P49019 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HCAR3P49019 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HCAR3P49019 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HCAR3P49019 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HCAR3P49019 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HCAR3P49019 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HCAR3P49019 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HCAR3P49019 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HCAR3P49019 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HCAR3P49019 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HCAR3P49019 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HCAR3P49019 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HCAR3P49019 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HCAR3P49019 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HCAR3P49019 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HCAR3P49019 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HCAR3P49019 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HCAR3P49019 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HCAR3P49019 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HCAR3P49019 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HCAR3P49019 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HCAR3P49019 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HCAR3P49019 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms